Les missions définies dans le plan de gestion sont d'ordre scientifiques et techniques, administratives ou liées à la communication et l'information du public
La réserve naturelle régionale de la Côte de Mancy revêt un caractère remarquable en Bourgogne-Franche-Comté de part son intérêt faunistique et floristique.
Le Massif du Jura connaît des changements climatiques impactant son patrimoine naturel et donc son développement économique et social basé sur ce patrimoine.